物理化學(xué)特性
光譜特征:在pH 7.0水溶液中,最大吸收波長約331 nm(ε ≈ 21,000 M?1cm?1),該吸收源于n-π*躍遷,常用于濃度定量。
反應(yīng)性:巰基/硫酮基具有親核性,易與烷基化試劑(如碘乙酰胺)或馬來酰亞胺發(fā)生加成反應(yīng),也可在UV 365 nm照射下與鄰近堿基交聯(lián)。
穩(wěn)定性:對(duì)酸敏感,強(qiáng)酸中糖苷鍵易水解;硫原子易被氧化為亞砜,需避光冷藏保存。
功能應(yīng)用
tRNA結(jié)構(gòu)穩(wěn)定劑:在細(xì)菌tRNA中作為保守修飾,通過增強(qiáng)堿基堆積力穩(wěn)定L形三級(jí)結(jié)構(gòu),提高翻譯準(zhǔn)確性。
RNA光交聯(lián)探針:將s?U摻入RNA后,紫外照射可使其與結(jié)合蛋白質(zhì)形成共價(jià)交聯(lián),用于繪制RNA-蛋白質(zhì)相互作用圖譜(如PAR-CLIP技術(shù))。
代謝標(biāo)記工具:在細(xì)胞培養(yǎng)中利用4-硫代尿苷(s?U)脈沖標(biāo)記新生RNA,通過生物素-馬來酰亞胺偶聯(lián)純化,分析轉(zhuǎn)錄組動(dòng)態(tài)(如SLAM-seq)。
實(shí)驗(yàn)反應(yīng)示例